A noter :
  340 chercheurs et 252 doctorants interviennent dans les domaines de la biologie, de la biochimie et de la santé
  Les principaux acteurs :
INSA de Lyon,
Université Claude Bernard Lyon 1
  Principales compétences : Agronomie ;
Bactéries ;
Biocapteurs optiques ;
Biochimie ;
Biochimie des lipides ;
Biodiversité ;
Biofilms ;
Bioinformatique ;
Biologie ;
Biomécanique ;
Biomembranes ;
Biotechnologies ;
Champignons ;
Collections et constructions de souches microbiennes ;
Environnement ;
Enzymes ;
Génome ;
Génétique (animale, humaine, micro-organismes, moléculaire, végétale, virale) ;
Imagerie médicale ;
Levures ;
Lipides ;
Mécanismes de régulation de l'expression des gènes ;
Métabolisme anaérobie ;
Microbiologie ;
Microbiologie moléculaire ;
Nanostructures biomimétiques ;
Pectinases ;
Pharmacologie ;
Produits naturels ;
Protéines membranaires ou à ancrage lipidique ;
Physiologie (insectes, microbes, environnements extrêmes, relations hôte/symbiote, sport) ;
Physiopathologie ;
Phytochimie ;
Puces à ADN ;
Régulation de la transcription ;
Revêtement anti-biofilms ;
Télémédecine ;
Traitement du signal ...

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L'agglomération lyonnaise représente un pôle français de première importance pour la recherche et le développement industriel dans le secteur de la biologie, de la biochimie et de la santé. Le Domaine Scientifique de la Doua assure l'essentiel de la formation des étudiants dans ce domaine, concentre une part significative du potentiel de recherche de ce secteur et permet le développement d'entreprises sur le site, en relation avec les laboratoires et les plate-formes technologiques. Il s'agit donc d'un site scientifique majeur de l'agglomération dans le domaine des sciences de la vie.
   
La densité des relations établies entre les laboratoires de la Doua et le monde industriel témoigne du fort impact socio-économique des recherches fondamentales qui y sont menées. 60% du budget global des structures de recherche est constitué de contrats avec des organismes de recherche (CNRS, INRA, INSERM, CEA, CEMAGREF, INRETS, IRD, CIRAD, etc.) et avec les services de recherche de nombreux groupes industriels (Danone, Aventis Pasteur, COFAZ, Total Fina Elf, Sanofi-Synthelabo, Vitaflor, LVMH, Lipha- Merck, BioMérieux, P. Fabre, ...).
   
La Doua regroupe un patrimoine scientifique exceptionnel sous la forme de ses collections (herbiers, paléontologie, zoologie), qui constituent des outils uniques pour les chercheurs nationaux et internationaux.

Recherche - Formation - La Doua : innovations et succès - Grands projets
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et les entreprises de cette filière, cliquez ici >>


Recherche :

16 laboratoires mènent des recherches dans les secteurs de la biologie, de la biochimie et de la santé ; toutefois, le Domaine Scientifique de la Doua intervient plus particulièrement en génétique, en bio-informatique, en biochimie, avec de nombreuses retombées en biotechnologies. Des capacités d'études importantes de la biodiversité et des milieux naturels existent sur le site. Un pôle fort est aussi représenté en imagerie médicale et en biochimie des lipides (IMBL). Enfin, de nombreuses plate-formes technologiques favorisent le développement de recherches fondamentales de pointe et le transfert de technologie vers l'industrie.


Génétique :
Génétique Moléculaire et biologie cellulaire : Le Centre de Génétique Moléculaire et Cellulaire vise à mieux comprendre comment s'inscrit dans le génome de la cellule, la réponse à diverses sollicitations physiologiques et non physiologiques. Ses domaines d'intervention sont l'étude des vertébrés et invertébrés, de l'humain et des virus. Des recherches sont notamment menées sur les molécules agissant sur le stress cellulaire, sur les stratégies vaccinales utilisant l'herpès simplex, sur la transgénèse (ver à soie, souris, nématode, drosophile).
   
Microbiologie et génétique : L'Unité de Microbiologie et Génétique intervient dans l'étude des stratégies adaptatives mises en œuvre par les micro-organismes, bactéries, champignons ou levures, en réponse aux variations de leur environnement biologique ou physico-chimique. Les principales orientations développées concernent la phytopathogénie, la structure et la biogenèse des enveloppes et le métabolisme cellulaire.
   
L'ensemble de ces recherches a un caractère fondamental dont les retombées appliquées intéressent les secteurs médical, agronomique ou industriel.


Bio-informatique :
Pôle Rhône-Alpin de Bio-informatique : S'appuyant sur des compétences en informatique, en statistiques, en analyse des données et en modélisation dynamique, le laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive développe des recherches sur la gestion, la représentation et la modélisation dans le domaine du génome. Ce laboratoire est un des trois membres fondateurs du PRABI (Pôle Rhône-Alpin de Bioinformatique) avec l'IBCP et le programme Hélix de l'INRIA. Il intervient fortement dans le programme de bioinformatique de la génopôle Rhône-Alpes.
   
Puces à ADN : Des recherches en bio-informatique des puces à ADN sont développées dans le laboratoire Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I). Cette recherche est centrée sur l'analyse du transcriptome de Buchnera, une bactérie endosymbiotique du puceron.


Biochimie :
Biochimie des Lipides : Plusieurs laboratoires de la Doua font partie de l'Institut Multidisciplinaire de Biochimie des Lipides (IMBL). Ce groupement d'intérêt scientifique a pour thèmes la biochimie des lipides et l'organisation des membranes biologiques, et dispose d'un plateau technique consacré en grande partie à l'étude des systèmes membranaires reconstitués.
   
Produits naturels : la modulation de la chimiorésistance par certains médiateurs chimiques est étudiée, ainsi que leurs applications aux interactions plantes/micro-organismes.
   
Enzymologie et bio-capteurs : Des capteurs enzymatiques sont développés et ont donné lieu à une commercialisation. Une autre orientation est de mieux connaître le mode d'action de quelques hydrolases bactériennes, d'une part pour en faciliter le dosage dans des milieux biologiques, et d'autre part pour les utiliser pour la synthèse, principalement en milieu non-aqueux, de peptides et de dérivés peptidiques.
   
Biomembranes et nanostructures biomimétiques : Les laboratoires de biochimie sont à l'interface de nombreuses disciplines biologiques, chimiques et physico-chimiques. Des liens avec d'autres filières sur la Doua, en particulier avec la chimie organique, les sciences analytiques ou la physique dans les domaines des nanotechnologies (étude des surfaces et interfaces appliquées aux membranes biologiques ou biomimétiques) sont établis. Cette collaboration est une spécificité du site de la Doua.


Biotechnologies :
Les biotechnologies, fondées sur la maîtrise du vivant, intègrent le progrès de plusieurs disciplines (de la biochimie à la génétique) et touchent à de nombreux domaines d'activités avec des applications multiples (santé, agriculture, environnement, agroalimentaire…). Quelques exemples de recherches menées sur la Doua :
   
Lutte contre les pollutions :
- Le Laboratoire d'Ecologie Microbienne étudie, par exemple, l'utilisation de certaines bactéries pour décontaminer les sols pollués.
- Le LAEPSI se penchent sur l'utilisation de micro-organismes pour traiter les eaux usées.
- Le laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Fluviaux mène des recherches sur l'évolution des écosystèmes aquatiques, les méthodes de diagnostic et de restauration par génie écologique.
   
Lutte contre les insectes ravageurs : L'Unité de Biologie Fonctionnelle, Insectes et Interactions (BF2I) étudie la physiologie et la génétique des insectes dans le cadre de leurs interactions entre eux et avec d'autres organismes (bactéries symbiotiques, plantes). Ces recherches contribuent à une approche intégrée de la protection des plantes contre les insectes ravageurs pour le développement d'une agriculture durable, respectueuse de l'environnement et de la santé humaine.
   
Lutte contre les contaminations et infections microbiennes par le biais de bio-films : une équipe de recherche de l'Unité de Microbiologie et Génétique est spécialisée dans la contamination microbienne de la surface des matériaux. Ses activités suivent trois axes : le développement de méthodes rapides de quantification et d'identification des contaminants, l'analyse des processus physiologiques impliqués dans la formation des biofilms microbiens et la mise au point de revêtements anti-contaminations. Cette équipe est impliquée dans une start-up de biotechnologie, dont la mission, au travers d'une activité de prestation de service et de production, est d'apporter des solutions aux entreprises et aux collectivités confrontées à des problèmes de contaminations et d'infections microbiennes.
   
Lutte contre le diabète : Une recherche en biochimie cellulaire orientée vers la santé, notamment dans le domaine du sang et des vaisseaux, s'est développée autour des mécanismes de signalisation cellulaire (lipides, nucléotides cycliques). Une des finalités concerne les complications vasculaires du diabète avec une équipe du groupe Lipha-Merck.
   
Surdités génétiques : Des recherches sont menées sur des gènes responsables de maladies neurosensorielles, principalement de surdités génétiques. La démarche est fondée sur la localisation chromosomique par analyse de liaison du gène morbide, sur la recherche d'un gène candidat et la validation de celui-ci par identification d'une (ou plusieurs) mutation(s), et sur l'étude fonctionnelle de la protéine correspondante.
   
Biocapteurs, biotests, bioindicateurs… : La mesure et le contrôle, par le biais de biocapteurs, de biotests ou de bioindicateurs mis au point par les laboratoires de la Doua, sont utilisés dans des secteurs variés : environnement, agro-alimentaire…


Biodiversité et Milieux Naturels :
Mieux connaître et mieux comprendre notre environnement, tels sont les objectifs des chercheurs analysant la biodiversité animale et végétale, et qui étudient notre environnement naturel.
   
Collections : L'Université Claude Bernard Lyon1 possède un patrimoine scientifique exceptionnel sous la forme de ses collections. Outre la collection de paléontologie, l'herbier ("Gandoger", "Bonaparte", …) et la collection de zoologie constituent des outils uniques mis à disposition des chercheurs nationaux et internationaux.
   
Biodiversité et écologie quantitative : L'objectif est l'acquisition de nouvelles connaissances fondée sur le développement de méthodes utilisant le concept, le langage et les résultats d'une discipline formelle (mathématiques ou informatique). Des recherches sont menées dans le cadre des systèmes dynamiques (principalement équations différentielles) et de l'analyse des données.
   
Phytochimie : Le laboratoire de Biologie Micromoléculaire et Phytochimie intervient dans l'étude des substances naturelles d'origine végétale. Les analyses physico-chimiques et structurales permettent d'objectiver des propriétés physiologiques valorisables dans les secteurs alimentaire, cosmétique et pharmaceutique, et de développer de nouvelles procédures de contrôle qualité, notamment pour l'agroalimentaire. Le BMP a acquis aussi une renommée importante dans l'étude des rosiers.

Imagerie médicale et santé :  
Imagerie médicale et télémédecine : Laboratoire pionnier dans le domaine de l'imagerie médicale, CREATIS est une unité de recherche bi-polaire science-médecine (imagerie dynamique pour suivre les évolutions de phénomènes complexes, imagerie volumique pour la reconstruction 3D, imagerie ultrasonore).
   
Géométrie discrète et imagerie : Des chercheurs de l'institut Girard Desargues travaillent à l'heure actuelle sur la définition de points de repères géométriques pour la superposition de deux radios prises à un intervalle de temps donné pour un même cerveau, et sur l'estimation de la modification de l'image dans cet intervalle de temps. La géométrie discrète devrait ainsi permettre une réelle progression en matière d'imagerie médicale.
   
Traitement du signal et biomédecine : Les applications du rayonnement ionisant et de la résonance magnétique nucléaire notamment dans le domaine biomédical sont mises en œuvre pour faire une caractérisation non destructive de matériaux ou établir des tomographies.
   
Effets des radiations sur l'ADN : des recherches sont menées pour mieux comprendre ces effets. L'Institut de Physique Nucléaire de Lyon est par ailleurs associé à un projet de construction d'un centre de traitement des tumeurs cancéreuses par hadronthérapie. Le principe : permettre la destruction des cellules cancéreuses radiorésistantes par l'envoi d'ions de carbone de grande vitesse.


Plate-formes technologiques :
  La Doua dispose de nombreux équipements de pointe dont certains sont concentrés dans des plate-formes technologiques accessibles aux chercheurs locaux, nationaux et internationaux :
- Centre de Microscopie électronique appliquée à la Biologie et la Géologie (CMEABG),
- Plate-forme de développement technologique et analyse moléculaire de la biodiversité (DTAMB),
- Plate-forme technologique de Biologie végétale (serres et chambres climatiques),
- Plate-forme Bioinformatique,
- Plate-forme technologique de Biologie des insectes (chambres climatiques, déterminations),
- Plate-forme de Biochimie et Biophysique analytique à haute performance, notamment pour l'étude des lipides et des systèmes membranaires reconstitués (Institut Multidisciplinaire de Biochimie des Lipides), …



Formation :

Formation initiale :

  INSA de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL).
Formation continue :
  INSACAST, Mission Formation Continue de l'INSA de Lyon, Service de formation continue de l'UCBL (FOCAL)

  Focus sur les principales formations :
 

DUT Génie Biologique (UCBL)
- Analyses biologiques et biochimiques
- Diététique
-
Agronomie

  Licence Sciences et Technologies (UCBL)
- mention Biochimie
- mention Biologie
- mention Mathématiques et Informatique du Vivant
  Licence Sciences et Techniques des Activités Physiques et Sportives
- mention Activités physiques adaptées
- mention Collectivités territoriales
- mention Education et motricité
- mention Entrainement sportif
  Master Sciences et Technologie, Santé (UCBL, en partenariat)
- mention Approches mathématique et informatique du vivant (INSA)
- mention Sciences des systèmes de santé
- mention Ecologie, écologie microbienne et évolution (INSA)
- mention Physiologie et neurosciences
- mention Biochimie (INSA)
- mention Biologie cellulaire et moléculaire et oncologie
- mention Ingénierie pour la santé
- mention Sciences du sport
  Ingéniorat (INSA Lyon) :
- Biochimie
- Bioinformatique et Modélisation
  Doctorat (Ecoles Doctorales)
- Biologie Moléculaire Intégrée et Cognitive
- Evolution, Ecosystèmes, Microbiologie, Modélisation
- Interdisciplinaire Science Santé
 

La Doua : quelques innovations et succès
Mieux visualiser le cœur pour prévenir les infarctus CREATIS L'infarctus est la 1ère cause de mortalité en France. CREATIS, en collaboration avec le corps médical et la société IôDP, a travaillé sur l'imagerie fonctionnelle de l'ischémie myocardique. Le but : développer une méthode permettant un diagnostic précis des différents états ischémiques. Ce diagnostic est nécessaire pour choisir parmi les nouvelles modalités thérapeutiques.
Microbiologie : LibraGen, une start-up issue des recherches menées sur la Doua Laboratoire d'Ecologie Microbienne Après une année dans l'incubateur rhône-alpin CREALYS, le projet de création d'entreprise porté par Renaud Nalin et valorisant les savoir-faire du laboratoire d'Ecologie Microbienne de l'UCBL a vu le jour. LibraGen est une société qui recherche à partir de nouvelles bioressources bactériennes des voies de biosynthèse de produits d'intérêt industriel encore inconnus. Aujourd'hui, la microbiologie est largement utilisée dans le monde industriel, toute cette utilisation ne repose que sur 1% de la biodiversité. LibraGen et le laboratoire d'Ecologie Microbienne développent des techniques permettant d'accéder au 99% de la diversité des bactéries encore inexploitée.
Le ver à soie, premier lépidoptère transgénique CGMC Le Centre de Génétique Moléculaire et Cellulaire et l'Unité Nationale Séricole à Lyon, dans le cadre d'une coopération internationale avec des chercheurs japonais et américains, ont mis au point une méthode de transgénèse extrêmement efficace, chez le Bombyx du mûrier. Le ver à soie a été ainsi le premier lépidoptère chez lequel on peut greffer des gènes étrangers dans son patrimoine génétique. Cette transformation stable de la lignée germinale du ver à soie a ouvert la voie à de prometteuses applications en recherche fondamentale et en biotechnologies.
Protéines végétales toxiques pour les insectes ravageurs de plantes BF2I

La recherche de nouvelles classes d'entomotoxines chez les végétaux est une étape importante du processus de création de variétés résistantes aux insectes ravageurs. L'Unité BF2I a découvert un nouveau polypeptide des légumineuses toxiques pour divers insectes (brevet BF 98 05 877) et procède à sa caractérisation et à l'étude de son mode d'action. D'origine végétale et issue d'une plante consommée régulièrement par l'homme, cette protéine doit être valorisée par son utilisation en transgénèse végétale pour la protection contre plusieurs insectes.

Aliments artificiels pour l'élevage de parasites ou prédateurs d'insectes ravageurs des plantes BF2I La lutte biologique conduite avec les ennemis naturels des insectes ravageurs des plantes cultivées permet de réduire les inconvénients liés à l'utilisation d'insecticides chimiques. L'unité BF2I, en collaboration avec d'autres laboratoires européens et la société BIOTOP, développe des aliments artificiels pour l'élevage d'insectes parasites ou prédateurs de ces ravageurs. Tout en abaissant les coûts, l'objectif est de fournir une meilleure maîtrise et une plus grande souplesse de la gestion de la production des insectes auxiliaires.


Grands projets
Recherche Pôle Rhône-Alpin de Bioinformatique (PRABI) La longue tradition bioinformatique de la Région a été initiée dans les années 70 sur le site de la Doua et y est actuellement fortement représentée par le Laboratoire de Biométrie et de Biologie Evolutive et une plate-forme technologique ouverte, le DTAMB (Développement Technologique et Analyse Moléculaire de la Biodiversité). Il était donc naturel que la Doua soit l'un des sites pilotes du Pôle bioinformatique lyonnais et du Pôle Rhône-Alpes de Bioinformatique, soutenu dans le cadre du Contrat de Plan Etat-Région 2000-2006.
Recherche
Plate-formes technologiques
Génopôle Rhône-Alpes Les "Génopoles", créées en 1999, sont des sites d'excellence dans le domaine de la génétique, susceptibles de conduire une recherche de haut niveau dans ce domaine et d'assurer sa valorisation. La Génopole Rhône-Alpes a été officiellement labellisée en Mars 2000. Plusieurs unités de recherche du Domaine Scientifique de la Doua sont fortement impliquées dans ce projet dont l'objectif est de fédérer et de soutenir les recherches conduites dans la région dans le secteur de la génomique et de la protéomique fonctionnelles (post-génome). Cinq plate-formes technologiques seront développées dans le cadre de la Génopole Rhône-Alpes. La Doua sera pilote pour deux d'entre elles, la plate-forme de Bioinformatique et la plate-forme pour l'étude du transcriptome et la production de biopuces.
Recherche Création de l'Institut Multidisciplinaire de Biochimie des Lipides (IMBL) L'IMBL s'est créé autour d'équipes de recherche publique (CNRS, INSA de Lyon, INSERM, Université Claude Bernard Lyon1, Ecole Centrale de Lyon), de recherche industrielle (Aldivia, Aventis, Lipha-Merck) dans le but d'avoir une approche aussi transversale que possible de la lipidologie. Dans ses orientations actuelles, l'IMBL se donne pour but l'étude des membranes biologiques (naturelles ou reconstituées), la chimie fine des molécules bioactives hydrophobes, les lipoprotéines, les lipides de signalisation cellulaire et les nutriments lipidiques. Doté d'une plate-forme de biochimie et biophysique analytiques à haute performance, l'IMBL propose des surfaces d'accueil à toute équipe ayant un projet de recherche dans le domaine des lipides. La diversité thématique dans ce champ d'étude est une richesse pour la transversalité, de nombreux bénéfices en sont attendus.


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