L'agglomération
lyonnaise représente un pôle français de première importance
pour la recherche et le développement industriel dans le secteur
de la biologie, de la biochimie et de la santé. Le Domaine Scientifique
de la Doua assure l'essentiel de la formation des étudiants
dans ce domaine, concentre une part significative du potentiel
de recherche de ce secteur et permet le développement d'entreprises
sur le site, en relation avec les laboratoires et les plate-formes
technologiques. Il s'agit donc d'un site scientifique majeur
de l'agglomération dans le domaine des sciences de la vie.
La
densité des relations établies entre les laboratoires de la
Doua et le monde industriel témoigne du fort impact socio-économique
des recherches fondamentales qui y sont menées. 60% du budget
global des structures de recherche est constitué de contrats
avec des organismes de recherche (CNRS, INRA, INSERM, CEA, CEMAGREF,
INRETS, IRD, CIRAD, etc.) et avec les services de recherche
de nombreux groupes industriels (Danone, Aventis Pasteur, COFAZ,
Total Fina Elf, Sanofi-Synthelabo, Vitaflor, LVMH, Lipha- Merck,
BioMérieux, P. Fabre, ...).
La
Doua regroupe un patrimoine scientifique exceptionnel sous la
forme de ses collections (herbiers, paléontologie, zoologie),
qui constituent des outils uniques pour les chercheurs nationaux
et internationaux.
Pour identifier les laboratoires de recherche
et les entreprises de cette filière, cliquez ici >>
Recherche
:
16 laboratoires
mènent des recherches dans les secteurs de la biologie, de la biochimie
et de la santé ; toutefois, le Domaine Scientifique de la Doua intervient
plus particulièrement en génétique, en
bio-informatique, en biochimie,
avec de nombreuses retombées en biotechnologies.
Des capacités d'études importantes de la biodiversité
et des milieux naturels existent sur le site. Un pôle fort est
aussi représenté en imagerie médicale et en
biochimie des lipides (IMBL). Enfin, de nombreuses
plate-formes technologiques favorisent
le développement de recherches fondamentales de pointe et le transfert
de technologie vers l'industrie.
Génétique
:
Génétique
Moléculaire et biologie cellulaire : Le Centre de Génétique Moléculaire
et Cellulaire vise à mieux comprendre comment s'inscrit dans le génome
de la cellule, la réponse à diverses sollicitations physiologiques
et non physiologiques. Ses domaines d'intervention sont l'étude des
vertébrés et invertébrés, de l'humain et des virus. Des recherches
sont notamment menées sur les molécules agissant sur le stress cellulaire,
sur les stratégies vaccinales utilisant l'herpès simplex, sur la transgénèse
(ver à soie, souris, nématode, drosophile).
Microbiologie
et génétique : L'Unité de Microbiologie et Génétique intervient
dans l'étude des stratégies adaptatives mises en œuvre par les micro-organismes,
bactéries, champignons ou levures, en réponse aux variations de leur
environnement biologique ou physico-chimique. Les principales orientations
développées concernent la phytopathogénie, la structure et la biogenèse
des enveloppes et le métabolisme cellulaire.
L'ensemble
de ces recherches a un caractère fondamental dont les retombées appliquées
intéressent les secteurs médical, agronomique ou industriel.
Bio-informatique
:
Pôle
Rhône-Alpin de Bio-informatique : S'appuyant sur des compétences
en informatique, en statistiques, en analyse des données et en modélisation
dynamique, le laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive développe
des recherches sur la gestion, la représentation et la modélisation
dans le domaine du génome. Ce laboratoire est un des trois membres
fondateurs du PRABI (Pôle Rhône-Alpin de Bioinformatique)
avec l'IBCP et le programme Hélix de l'INRIA. Il intervient fortement
dans le programme de bioinformatique de la génopôle
Rhône-Alpes.
Puces
à ADN : Des recherches en bio-informatique des puces à ADN sont
développées dans le laboratoire Biologie Fonctionnelle, Insectes et
Interactions (BF2I). Cette recherche est centrée sur l'analyse du
transcriptome de Buchnera, une bactérie endosymbiotique du puceron.
Biochimie
:
Biochimie
des Lipides : Plusieurs laboratoires de la Doua font partie de
l'Institut Multidisciplinaire de Biochimie des Lipides (IMBL). Ce
groupement d'intérêt scientifique a pour thèmes la biochimie des lipides
et l'organisation des membranes biologiques, et dispose d'un plateau
technique consacré en grande partie à l'étude des systèmes membranaires
reconstitués.
Produits
naturels : la modulation de la chimiorésistance par certains médiateurs
chimiques est étudiée, ainsi que leurs applications aux interactions
plantes/micro-organismes.
Enzymologie
et bio-capteurs : Des capteurs enzymatiques sont développés et
ont donné lieu à une commercialisation. Une autre orientation est
de mieux connaître le mode d'action de quelques hydrolases bactériennes,
d'une part pour en faciliter le dosage dans des milieux biologiques,
et d'autre part pour les utiliser pour la synthèse, principalement
en milieu non-aqueux, de peptides et de dérivés peptidiques.
Biomembranes
et nanostructures biomimétiques : Les laboratoires de biochimie
sont à l'interface de nombreuses disciplines biologiques, chimiques
et physico-chimiques. Des liens avec d'autres filières sur la Doua,
en particulier avec la chimie organique, les sciences analytiques
ou la physique dans les domaines des nanotechnologies (étude des surfaces
et interfaces appliquées aux membranes biologiques ou biomimétiques)
sont établis. Cette collaboration est une spécificité du site de la
Doua.
Biotechnologies
:
Les
biotechnologies, fondées sur la maîtrise du vivant, intègrent
le progrès de plusieurs disciplines (de la biochimie à la génétique)
et touchent à de nombreux domaines d'activités avec des applications
multiples (santé, agriculture, environnement, agroalimentaire…).
Quelques exemples de recherches menées sur la Doua :
Lutte contre les pollutions : - Le Laboratoire d'Ecologie Microbienne étudie, par exemple,
l'utilisation de certaines bactéries pour décontaminer les sols
pollués.
- Le LAEPSI se penchent sur l'utilisation de micro-organismes
pour traiter les eaux usées.
- Le laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Fluviaux mène
des recherches sur l'évolution des écosystèmes aquatiques, les
méthodes de diagnostic et de restauration par génie écologique.
Lutte
contre les insectes ravageurs : L'Unité de Biologie Fonctionnelle,
Insectes et Interactions (BF2I) étudie la physiologie et la
génétique des insectes dans le cadre de leurs interactions entre
eux et avec d'autres organismes (bactéries symbiotiques, plantes).
Ces recherches contribuent à une approche intégrée de la protection
des plantes contre les insectes ravageurs pour le développement
d'une agriculture durable, respectueuse de l'environnement et
de la santé humaine.
Lutte contre les contaminations et infections microbiennes par
le biais de bio-films : une équipe de recherche de l'Unité
de Microbiologie et Génétique est spécialisée dans la contamination
microbienne de la surface des matériaux. Ses activités suivent
trois axes : le développement de méthodes rapides de quantification
et d'identification des contaminants, l'analyse des processus
physiologiques impliqués dans la formation des biofilms microbiens
et la mise au point de revêtements anti-contaminations. Cette
équipe est impliquée dans une start-up de biotechnologie, dont
la mission, au travers d'une activité de prestation de service
et de production, est d'apporter des solutions aux entreprises
et aux collectivités confrontées à des problèmes de contaminations
et d'infections microbiennes.
Lutte
contre le diabète : Une recherche en biochimie cellulaire
orientée vers la santé, notamment dans le domaine du sang et
des vaisseaux, s'est développée autour des mécanismes de signalisation
cellulaire (lipides, nucléotides cycliques). Une des finalités
concerne les complications vasculaires du diabète avec une équipe
du groupe Lipha-Merck.
Surdités
génétiques : Des recherches sont menées sur des gènes responsables
de maladies neurosensorielles, principalement de surdités génétiques.
La démarche est fondée sur la localisation chromosomique par
analyse de liaison du gène morbide, sur la recherche d'un gène
candidat et la validation de celui-ci par identification d'une
(ou plusieurs) mutation(s), et sur l'étude fonctionnelle de la
protéine correspondante.
Biocapteurs,
biotests, bioindicateurs… : La mesure et le contrôle, par
le biais de biocapteurs, de biotests ou de bioindicateurs mis
au point par les laboratoires de la Doua, sont utilisés dans
des secteurs variés : environnement, agro-alimentaire…
Biodiversité
et Milieux Naturels :
Mieux
connaître et mieux comprendre notre environnement, tels sont
les objectifs des chercheurs analysant la biodiversité animale
et végétale, et qui étudient notre environnement naturel.
Collections : L'Université Claude Bernard Lyon1 possède
un patrimoine scientifique exceptionnel sous la forme de ses
collections. Outre la collection de paléontologie, l'herbier
("Gandoger", "Bonaparte", …) et la collection de zoologie constituent
des outils uniques mis à disposition des chercheurs nationaux
et internationaux.
Biodiversité
et écologie quantitative : L'objectif est l'acquisition
de nouvelles connaissances fondée sur le développement de méthodes
utilisant le concept, le langage et les résultats d'une discipline
formelle (mathématiques ou informatique). Des recherches sont
menées dans le cadre des systèmes dynamiques (principalement
équations différentielles) et de l'analyse des données.
Phytochimie : Le laboratoire de Biologie Micromoléculaire
et Phytochimie intervient dans l'étude des substances naturelles
d'origine végétale. Les analyses physico-chimiques et structurales
permettent d'objectiver des propriétés physiologiques valorisables
dans les secteurs alimentaire, cosmétique et pharmaceutique,
et de développer de nouvelles procédures de contrôle qualité,
notamment pour l'agroalimentaire. Le BMP a acquis aussi une
renommée importante dans l'étude des rosiers.
Imagerie
médicale et santé :
Imagerie
médicale et télémédecine : Laboratoire pionnier dans le domaine
de l'imagerie médicale, CREATIS est une unité de recherche bi-polaire
science-médecine (imagerie dynamique pour suivre les évolutions de
phénomènes complexes, imagerie volumique pour la reconstruction 3D,
imagerie ultrasonore).
Géométrie
discrète et imagerie : Des chercheurs de l'institut Girard Desargues
travaillent à l'heure actuelle sur la définition de points de repères
géométriques pour la superposition de deux radios prises à un intervalle
de temps donné pour un même cerveau, et sur l'estimation de la modification
de l'image dans cet intervalle de temps. La géométrie discrète devrait
ainsi permettre une réelle progression en matière d'imagerie médicale.
Traitement
du signal et biomédecine : Les applications du rayonnement ionisant
et de la résonance magnétique nucléaire notamment dans le domaine
biomédical sont mises en œuvre pour faire une caractérisation non
destructive de matériaux ou établir des tomographies.
Effets
des radiations sur l'ADN : des recherches sont menées pour mieux
comprendre ces effets. L'Institut de Physique Nucléaire de Lyon est
par ailleurs associé à un projet de construction d'un centre de traitement
des tumeurs cancéreuses par hadronthérapie. Le principe : permettre
la destruction des cellules cancéreuses radiorésistantes par l'envoi
d'ions de carbone de grande vitesse.
Plate-formes
technologiques :
La
Doua dispose de nombreux équipements de pointe dont certains sont
concentrés dans des plate-formes technologiques accessibles aux chercheurs
locaux, nationaux et internationaux :
- Centre de Microscopie électronique appliquée à la Biologie et la
Géologie (CMEABG),
- Plate-forme de développement technologique et analyse moléculaire
de la biodiversité (DTAMB),
- Plate-forme technologique de Biologie végétale (serres et chambres
climatiques),
- Plate-forme Bioinformatique,
- Plate-forme technologique de Biologie des insectes (chambres climatiques,
déterminations),
- Plate-forme de Biochimie et Biophysique analytique à haute performance,
notamment pour l'étude des lipides et des systèmes membranaires reconstitués
(Institut Multidisciplinaire de Biochimie des Lipides), …
Formation
:
Formation
initiale :
INSA
de Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL).
Formation
continue :
INSACAST,
Mission Formation Continue de l'INSA de Lyon, Service de formation
continue de l'UCBL (FOCAL)
Licence Sciences et Technologies (UCBL)
- mention Biochimie
- mention Biologie
- mention Mathématiques et Informatique du Vivant
Licence Sciences et Techniques des Activités Physiques
et Sportives
- mention Activités physiques adaptées
- mention Collectivités territoriales
- mention Education et motricité
- mention Entrainement sportif
Master Sciences et Technologie, Santé (UCBL, en
partenariat)
- mention Approches mathématique et informatique
du vivant (INSA)
- mention Sciences des systèmes de santé
- mention Ecologie, écologie microbienne et évolution
(INSA)
- mention Physiologie et neurosciences
- mention Biochimie (INSA)
- mention Biologie cellulaire et moléculaire et
oncologie
- mention Ingénierie pour la santé
- mention Sciences du sport
Ingéniorat (INSA Lyon) :
- Biochimie
- Bioinformatique et Modélisation
Mieux
visualiser le cœur pour prévenir les infarctus
CREATIS
L'infarctus
est la 1ère cause de mortalité en France. CREATIS, en collaboration
avec le corps médical et la société IôDP, a travaillé sur l'imagerie
fonctionnelle de l'ischémie myocardique. Le but : développer
une méthode permettant un diagnostic précis des différents états
ischémiques. Ce diagnostic est nécessaire pour choisir parmi
les nouvelles modalités thérapeutiques.
Microbiologie
: LibraGen, une start-up issue des recherches menées sur la
Doua
Laboratoire
d'Ecologie Microbienne
Après
une année dans l'incubateur rhône-alpin CREALYS, le projet de
création d'entreprise porté par Renaud Nalin et valorisant les
savoir-faire du laboratoire d'Ecologie Microbienne de l'UCBL
a vu le jour. LibraGen est une société qui recherche à partir
de nouvelles bioressources bactériennes des voies de biosynthèse
de produits d'intérêt industriel encore inconnus. Aujourd'hui,
la microbiologie est largement utilisée dans le monde industriel,
toute cette utilisation ne repose que sur 1% de la biodiversité.
LibraGen et le laboratoire d'Ecologie Microbienne développent
des techniques permettant d'accéder au 99% de la diversité des
bactéries encore inexploitée.
Le
ver à soie, premier lépidoptère transgénique
CGMC
Le
Centre de Génétique Moléculaire et Cellulaire et l'Unité Nationale
Séricole à Lyon, dans le cadre d'une coopération internationale
avec des chercheurs japonais et américains, ont mis au point
une méthode de transgénèse extrêmement efficace, chez le Bombyx
du mûrier. Le ver à soie a été ainsi le premier lépidoptère
chez lequel on peut greffer des gènes étrangers dans son patrimoine
génétique. Cette transformation stable de la lignée germinale
du ver à soie a ouvert la voie à de prometteuses applications
en recherche fondamentale et en biotechnologies.
Protéines
végétales toxiques pour les insectes ravageurs de plantes
BF2I
La recherche
de nouvelles classes d'entomotoxines chez les végétaux est
une étape importante du processus de création de variétés
résistantes aux insectes ravageurs. L'Unité BF2I a découvert
un nouveau polypeptide des légumineuses toxiques pour divers
insectes (brevet BF 98 05 877) et procède à sa caractérisation
et à l'étude de son mode d'action. D'origine végétale et issue
d'une plante consommée régulièrement par l'homme, cette protéine
doit être valorisée par son utilisation en transgénèse végétale
pour la protection contre plusieurs insectes.
Aliments
artificiels pour l'élevage de parasites ou prédateurs d'insectes
ravageurs des plantes
BF2I
La
lutte biologique conduite avec les ennemis naturels des insectes
ravageurs des plantes cultivées permet de réduire les inconvénients
liés à l'utilisation d'insecticides chimiques. L'unité BF2I,
en collaboration avec d'autres laboratoires européens et la
société BIOTOP, développe des aliments artificiels pour l'élevage
d'insectes parasites ou prédateurs de ces ravageurs. Tout en
abaissant les coûts, l'objectif est de fournir une meilleure
maîtrise et une plus grande souplesse de la gestion de la production
des insectes auxiliaires.
Grands
projets
Recherche
Pôle
Rhône-Alpin de Bioinformatique (PRABI)
La
longue tradition bioinformatique de la Région a été initiée
dans les années 70 sur le site de la Doua et y est actuellement
fortement représentée par le Laboratoire de Biométrie et de
Biologie Evolutive et une plate-forme technologique ouverte,
le DTAMB (Développement Technologique et Analyse Moléculaire
de la Biodiversité). Il était donc naturel que la Doua soit
l'un des sites pilotes du Pôle bioinformatique lyonnais et du
Pôle Rhône-Alpes de Bioinformatique, soutenu dans le cadre du
Contrat de Plan Etat-Région 2000-2006.
Recherche
Plate-formes technologiques
Génopôle
Rhône-Alpes
Les
"Génopoles", créées en 1999, sont des sites d'excellence dans
le domaine de la génétique, susceptibles de conduire une recherche
de haut niveau dans ce domaine et d'assurer sa valorisation.
La Génopole Rhône-Alpes a été officiellement labellisée
en Mars 2000. Plusieurs unités de recherche du Domaine Scientifique
de la Doua sont fortement impliquées dans ce projet dont l'objectif
est de fédérer et de soutenir les recherches conduites dans
la région dans le secteur de la génomique et de la protéomique
fonctionnelles (post-génome). Cinq plate-formes technologiques
seront développées dans le cadre de la Génopole Rhône-Alpes.
La Doua sera pilote pour deux d'entre elles, la plate-forme
de Bioinformatique et la plate-forme pour l'étude
du transcriptome et la production de biopuces.
Recherche
Création
de l'Institut Multidisciplinaire de Biochimie des Lipides (IMBL)
L'IMBL
s'est créé autour d'équipes de recherche publique (CNRS,
INSA de Lyon, INSERM, Université Claude Bernard Lyon1,
Ecole Centrale de Lyon), de recherche industrielle (Aldivia,
Aventis, Lipha-Merck) dans le but d'avoir une approche aussi
transversale que possible de la lipidologie. Dans ses orientations
actuelles, l'IMBL se donne pour but l'étude des membranes biologiques
(naturelles ou reconstituées), la chimie fine des molécules
bioactives hydrophobes, les lipoprotéines, les lipides de signalisation
cellulaire et les nutriments lipidiques. Doté d'une plate-forme
de biochimie et biophysique analytiques à haute performance,
l'IMBL propose des surfaces d'accueil à toute équipe ayant un
projet de recherche dans le domaine des lipides. La diversité
thématique dans ce champ d'étude est une richesse pour la transversalité,
de nombreux bénéfices en sont attendus.
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